Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIA4P48058 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms