Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC4P43686 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMC4P43686 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSMC4P43686 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms