Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD52P43351 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD52P43351 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD52P43351 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD52P43351 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD52P43351 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD52P43351 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD52P43351 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD52P43351 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD52P43351 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD52P43351 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD52P43351 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD52P43351 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD52P43351 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD52P43351 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD52P43351 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD52P43351 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD52P43351 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD52P43351 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD52P43351 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD52P43351 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD52P43351 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD52P43351 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD52P43351 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD52P43351 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD52P43351 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD52P43351 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD52P43351 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD52P43351 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD52P43351 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD52P43351 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD52P43351 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD52P43351 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD52P43351 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD52P43351 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD52P43351 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD52P43351 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD52P43351 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD52P43351 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD52P43351 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD52P43351 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD52P43351 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD52P43351 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD52P43351 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD52P43351 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD52P43351 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms