Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR2P43308 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR2P43308 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR2P43308 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR2P43308 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR2P43308 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR2P43308 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR2P43308 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR2P43308 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR2P43308 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR2P43308 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR2P43308 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR2P43308 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR2P43308 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSR2P43308 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR2P43308 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR2P43308 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR2P43308 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR2P43308 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR2P43308 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR2P43308 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR2P43308 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR2P43308 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR2P43308 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR2P43308 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR2P43308 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR2P43308 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR2P43308 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR2P43308 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR2P43308 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR2P43308 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR2P43308 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR2P43308 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR2P43308 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR2P43308 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR2P43308 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR2P43308 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR2P43308 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR2P43308 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR2P43308 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR2P43308 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR2P43308 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR2P43308 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR2P43308 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR2P43308 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR2P43308 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR2P43308 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR2P43308 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR2P43308 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR2P43308 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR2P43308 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR2P43308 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR2P43308 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR2P43308 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR2P43308 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR2P43308 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR2P43308 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR2P43308 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR2P43308 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR2P43308 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR2P43308 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR2P43308 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR2P43308 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms