Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YJR107WYJR107W 987 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SLA2YNL243W 2907 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 EMP65YER140W 1671 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YKR032WYKR032W 315 nt5.65□□□□□ -1.5
CCS1P40202 TOS6YNL300W 309 nt5.65□□□□□ -1.5
CCS1P40202 MCP1YOR228C 909 nt5.65□□□□□ -1.5
CCS1P40202 ECM30YLR436C 3825 nt5.64□□□□□ -1.51
CCS1P40202 HSP12YFL014W 330 nt5.64□□□□□ -1.51
CCS1P40202 YPT1YFL038C 621 nt5.64□□□□□ -1.51
CCS1P40202 SPE3YPR069C 882 nt5.64□□□□□ -1.51
CCS1P40202 EDE1YBL047C 4146 nt5.63□□□□□ -1.51
CCS1P40202 SUR7YML052W 909 nt5.63□□□□□ -1.51
CCS1P40202 ASR1YPR093C 867 nt5.63□□□□□ -1.51
CCS1P40202 COX10YPL172C 1389 nt5.63□□□□□ -1.51
CCS1P40202 COQ1YBR003W 1422 nt5.63□□□□□ -1.51
CCS1P40202 PRY3YJL078C 2646 nt5.62□□□□□ -1.51
CCS1P40202 STT3YGL022W 2157 nt5.62□□□□□ -1.51
CCS1P40202 KSH1YNL024C-A 219 nt5.62□□□□□ -1.51
CCS1P40202 COX15YER141W 1461 nt5.62□□□□□ -1.51
CCS1P40202 DOT1YDR440W 1749 nt5.62□□□□□ -1.51
CCS1P40202 HEM1YDR232W 1647 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 CTF8YHR191C 402 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 ARP3YJR065C 1350 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 MIA40YKL195W 1212 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 URA1YKL216W 945 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 YNL092WYNL092W 1203 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 AAD14YNL331C 1131 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 COS10YNR075W 1125 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 RFC4YOL094C 972 nt5.61□□□□□ -1.51
CCS1P40202 SKY1YMR216C 2229 nt5.6□□□□□ -1.51
CCS1P40202 DAL4YIR028W 1908 nt5.6□□□□□ -1.51
CCS1P40202 CLN1YMR199W 1641 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 YHK8YHR048W 1545 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 ECM38YLR299W 1983 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 BDF2YDL070W 1917 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 HOC1YJR075W 1191 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 RNH1YMR234W 1047 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 YBR113WYBR113W 483 nt5.59□□□□□ -1.51
CCS1P40202 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.58□□□□□ -1.52
CCS1P40202 LIA1YJR070C 978 nt5.58□□□□□ -1.52
CCS1P40202 HMS2YJR147W 1077 nt5.58□□□□□ -1.52
CCS1P40202 LDB7YBL006C 543 nt5.58□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YRB2YIL063C 984 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YJR146WYJR146W 354 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 FBA1YKL060C 1080 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 DFR1YOR236W 636 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 RSP5YER125W 2430 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 FMP40YPL222W 2067 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 BIO3YNR058W 1443 nt5.57□□□□□ -1.52
CCS1P40202 FRE5YOR384W 2085 nt5.56□□□□□ -1.52
CCS1P40202 GPD1YDL022W 1176 nt5.56□□□□□ -1.52
CCS1P40202 TPK1YJL164C 1194 nt5.56□□□□□ -1.52
CCS1P40202 OGG1YML060W 1131 nt5.56□□□□□ -1.52
CCS1P40202 CCC2YDR270W 3015 nt5.56□□□□□ -1.52
CCS1P40202 PLB3YOL011W 2061 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 SES1YDR023W 1389 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 THI2YBR240C 1353 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YHR131CYHR131C 2553 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YKL077WYKL077W 1179 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YKL102CYKL102C 306 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YAR064WYAR064W 300 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YNL120CYNL120C 486 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 PMT3YOR321W 2262 nt5.55□□□□□ -1.52
CCS1P40202 CYS4YGR155W 1524 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 PEX3YDR329C 1326 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 MIP1YOR330C 3765 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 MRPL35YDR322W 1104 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 RPP1YHR062C 882 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 AIM33YML087C 939 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 MRPL23YOR150W 492 nt5.54□□□□□ -1.52
CCS1P40202 MPH3YJR160C 1809 nt5.53□□□□□ -1.52
CCS1P40202 SQT1YIR012W 1296 nt5.53□□□□□ -1.52
CCS1P40202 ASF1YJL115W 840 nt5.53□□□□□ -1.52
CCS1P40202 RUF23RUF23 254 nt5.53□□□□□ -1.52
CCS1P40202 YPL257WYPL257W 582 nt5.53□□□□□ -1.52
CCS1P40202 CRH1YGR189C 1524 nt5.53□□□□□ -1.52
CCS1P40202 MSY1YPL097W 1479 nt5.52□□□□□ -1.53
CCS1P40202 FAL1YDR021W 1200 nt5.52□□□□□ -1.53
CCS1P40202 QCR6YFR033C 444 nt5.52□□□□□ -1.53
CCS1P40202 COX5AYNL052W 462 nt5.52□□□□□ -1.53
CCS1P40202 VMA2YBR127C 1554 nt5.51□□□□□ -1.53
CCS1P40202 UTR2YEL040W 1404 nt5.51□□□□□ -1.53
CCS1P40202 LYS1YIR034C 1122 nt5.51□□□□□ -1.53
CCS1P40202 TAF9YMR236W 474 nt5.51□□□□□ -1.53
CCS1P40202 UBP13YBL067C 2244 nt5.5□□□□□ -1.53
CCS1P40202 FMO1YHR176W 1299 nt5.5□□□□□ -1.53
CCS1P40202 LSC1YOR142W 990 nt5.5□□□□□ -1.53
CCS1P40202 YBR284WYBR284W 2394 nt5.49□□□□□ -1.53
CCS1P40202 FPR2YDR519W 408 nt5.49□□□□□ -1.53
CCS1P40202 GTT3YEL017W 1014 nt5.49□□□□□ -1.53
CCS1P40202 LCL3YGL085W 825 nt5.49□□□□□ -1.53
CCS1P40202 AIM24YJR080C 1185 nt5.49□□□□□ -1.53
CCS1P40202 RGT2YDL138W 2292 nt5.48□□□□□ -1.53
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