Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA1P35221 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA1P35221 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms