Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA3P34903 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA3P34903 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRA3P34903 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA3P34903 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms