Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSP1P33241 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSP1P33241 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSP1P33241 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSP1P33241 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSP1P33241 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSP1P33241 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSP1P33241 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSP1P33241 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSP1P33241 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LSP1P33241 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSP1P33241 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSP1P33241 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSP1P33241 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSP1P33241 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSP1P33241 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSP1P33241 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSP1P33241 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSP1P33241 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSP1P33241 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSP1P33241 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LSP1P33241 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSP1P33241 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSP1P33241 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSP1P33241 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSP1P33241 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSP1P33241 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSP1P33241 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSP1P33241 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSP1P33241 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LSP1P33241 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSP1P33241 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSP1P33241 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSP1P33241 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSP1P33241 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSP1P33241 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSP1P33241 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSP1P33241 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSP1P33241 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSP1P33241 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSP1P33241 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSP1P33241 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LSP1P33241 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSP1P33241 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSP1P33241 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LSP1P33241 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSP1P33241 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSP1P33241 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSP1P33241 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSP1P33241 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSP1P33241 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSP1P33241 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSP1P33241 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSP1P33241 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSP1P33241 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSP1P33241 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSP1P33241 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSP1P33241 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSP1P33241 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSP1P33241 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSP1P33241 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSP1P33241 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSP1P33241 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSP1P33241 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms