Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA3P32297 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA3P32297 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms