Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDC4P31431 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDC4P31431 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDC4P31431 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDC4P31431 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDC4P31431 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDC4P31431 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDC4P31431 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDC4P31431 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDC4P31431 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDC4P31431 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDC4P31431 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDC4P31431 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDC4P31431 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDC4P31431 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDC4P31431 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDC4P31431 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SDC4P31431 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDC4P31431 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC4P31431 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SDC4P31431 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDC4P31431 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDC4P31431 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC4P31431 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC4P31431 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC4P31431 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC4P31431 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC4P31431 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC4P31431 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC4P31431 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC4P31431 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC4P31431 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC4P31431 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC4P31431 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDC4P31431 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDC4P31431 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDC4P31431 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDC4P31431 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDC4P31431 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDC4P31431 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC4P31431 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDC4P31431 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDC4P31431 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDC4P31431 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDC4P31431 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC4P31431 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDC4P31431 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SDC4P31431 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDC4P31431 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDC4P31431 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDC4P31431 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDC4P31431 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDC4P31431 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDC4P31431 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDC4P31431 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDC4P31431 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SDC4P31431 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDC4P31431 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms