Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA13P31271 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA13P31271 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXA13P31271 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms