Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH3A1P30838 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH3A1P30838 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH3A1P30838 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH3A1P30838 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms