Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A1P30825 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A1P30825 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms