Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-FP30511 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-FP30511 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms