Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP11P24347 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP11P24347 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP11P24347 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP11P24347 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP11P24347 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP11P24347 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP11P24347 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP11P24347 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP11P24347 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP11P24347 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP11P24347 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP11P24347 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP11P24347 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP11P24347 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP11P24347 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP11P24347 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP11P24347 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP11P24347 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP11P24347 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP11P24347 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP11P24347 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP11P24347 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP11P24347 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP11P24347 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP11P24347 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP11P24347 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP11P24347 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP11P24347 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP11P24347 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP11P24347 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP11P24347 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP11P24347 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP11P24347 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP11P24347 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP11P24347 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP11P24347 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP11P24347 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP11P24347 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP11P24347 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP11P24347 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP11P24347 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP11P24347 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP11P24347 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP11P24347 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP11P24347 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP11P24347 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP11P24347 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP11P24347 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP11P24347 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP11P24347 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP11P24347 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP11P24347 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP11P24347 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP11P24347 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP11P24347 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP11P24347 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms