Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF6P23409 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF6P23409 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF6P23409 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF6P23409 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF6P23409 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF6P23409 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF6P23409 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF6P23409 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF6P23409 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF6P23409 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF6P23409 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF6P23409 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF6P23409 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF6P23409 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF6P23409 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF6P23409 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF6P23409 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF6P23409 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF6P23409 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF6P23409 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF6P23409 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF6P23409 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF6P23409 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF6P23409 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF6P23409 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF6P23409 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF6P23409 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYF6P23409 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYF6P23409 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYF6P23409 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF6P23409 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF6P23409 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF6P23409 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF6P23409 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF6P23409 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF6P23409 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF6P23409 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF6P23409 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYF6P23409 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF6P23409 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF6P23409 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF6P23409 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF6P23409 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF6P23409 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF6P23409 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF6P23409 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF6P23409 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF6P23409 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms