Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCP2P22307 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCP2P22307 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCP2P22307 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCP2P22307 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCP2P22307 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCP2P22307 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCP2P22307 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCP2P22307 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCP2P22307 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCP2P22307 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCP2P22307 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCP2P22307 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCP2P22307 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCP2P22307 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCP2P22307 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCP2P22307 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCP2P22307 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCP2P22307 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCP2P22307 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCP2P22307 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCP2P22307 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCP2P22307 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCP2P22307 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCP2P22307 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCP2P22307 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCP2P22307 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCP2P22307 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCP2P22307 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCP2P22307 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCP2P22307 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCP2P22307 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCP2P22307 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCP2P22307 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCP2P22307 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCP2P22307 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCP2P22307 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCP2P22307 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCP2P22307 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCP2P22307 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCP2P22307 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCP2P22307 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCP2P22307 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCP2P22307 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCP2P22307 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCP2P22307 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCP2P22307 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCP2P22307 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCP2P22307 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCP2P22307 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCP2P22307 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCP2P22307 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCP2P22307 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCP2P22307 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCP2P22307 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCP2P22307 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCP2P22307 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCP2P22307 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCP2P22307 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCP2P22307 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCP2P22307 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms