Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP3P21580 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP3P21580 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP3P21580 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms