Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP4AP20648 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP4AP20648 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms