Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM21P19474 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM21P19474 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms