Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH2P19022 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH2P19022 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH2P19022 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH2P19022 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH2P19022 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH2P19022 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH2P19022 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH2P19022 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH2P19022 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH2P19022 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH2P19022 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH2P19022 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH2P19022 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH2P19022 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH2P19022 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH2P19022 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH2P19022 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH2P19022 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH2P19022 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH2P19022 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH2P19022 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH2P19022 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH2P19022 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH2P19022 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH2P19022 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH2P19022 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH2P19022 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH2P19022 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH2P19022 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH2P19022 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms