Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
XBP1P17861 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XBP1P17861 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XBP1P17861 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XBP1P17861 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XBP1P17861 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XBP1P17861 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XBP1P17861 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XBP1P17861 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XBP1P17861 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XBP1P17861 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XBP1P17861 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XBP1P17861 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XBP1P17861 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XBP1P17861 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XBP1P17861 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XBP1P17861 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XBP1P17861 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XBP1P17861 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XBP1P17861 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
XBP1P17861 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XBP1P17861 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
XBP1P17861 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XBP1P17861 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XBP1P17861 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XBP1P17861 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XBP1P17861 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XBP1P17861 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XBP1P17861 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XBP1P17861 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XBP1P17861 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XBP1P17861 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XBP1P17861 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
XBP1P17861 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
XBP1P17861 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XBP1P17861 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XBP1P17861 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XBP1P17861 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XBP1P17861 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XBP1P17861 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XBP1P17861 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XBP1P17861 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XBP1P17861 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XBP1P17861 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XBP1P17861 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XBP1P17861 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XBP1P17861 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XBP1P17861 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XBP1P17861 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XBP1P17861 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XBP1P17861 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XBP1P17861 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XBP1P17861 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
XBP1P17861 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XBP1P17861 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XBP1P17861 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XBP1P17861 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
XBP1P17861 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XBP1P17861 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms