Protein–RNA interactions for Protein: P17693

HLA-G, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain G, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-GP17693 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-GP17693 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-GP17693 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-GP17693 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms