Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOT1P17174 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOT1P17174 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOT1P17174 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOT1P17174 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1P17174 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1P17174 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1P17174 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
GOT1P17174 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1P17174 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1P17174 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1P17174 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1P17174 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1P17174 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1P17174 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOT1P17174 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOT1P17174 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOT1P17174 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOT1P17174 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOT1P17174 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOT1P17174 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOT1P17174 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1P17174 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1P17174 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1P17174 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1P17174 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1P17174 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1P17174 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1P17174 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1P17174 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOT1P17174 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOT1P17174 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOT1P17174 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOT1P17174 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOT1P17174 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOT1P17174 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GOT1P17174 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOT1P17174 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOT1P17174 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1P17174 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1P17174 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1P17174 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1P17174 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1P17174 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1P17174 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1P17174 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOT1P17174 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1P17174 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1P17174 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1P17174 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1P17174 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1P17174 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOT1P17174 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOT1P17174 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOT1P17174 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1P17174 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1P17174 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1P17174 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1P17174 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOT1P17174 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOT1P17174 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOT1P17174 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOT1P17174 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOT1P17174 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOT1P17174 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOT1P17174 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOT1P17174 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1P17174 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1P17174 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1P17174 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1P17174 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms