Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF43P17038 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF43P17038 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF43P17038 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms