Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTLA4P16410 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms