Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDGFRAP16234 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRAP16234 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRAP16234 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms