Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MYOD1P15172 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYOD1P15172 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYOD1P15172 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms