Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRF1P14222 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRF1P14222 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRF1P14222 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRF1P14222 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRF1P14222 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRF1P14222 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRF1P14222 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRF1P14222 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRF1P14222 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRF1P14222 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRF1P14222 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRF1P14222 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRF1P14222 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRF1P14222 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRF1P14222 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRF1P14222 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRF1P14222 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRF1P14222 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRF1P14222 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRF1P14222 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRF1P14222 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRF1P14222 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRF1P14222 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRF1P14222 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRF1P14222 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRF1P14222 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRF1P14222 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRF1P14222 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRF1P14222 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms