Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG2P13727 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG2P13727 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG2P13727 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG2P13727 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG2P13727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG2P13727 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG2P13727 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG2P13727 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRG2P13727 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG2P13727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG2P13727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG2P13727 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG2P13727 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG2P13727 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG2P13727 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG2P13727 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG2P13727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG2P13727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG2P13727 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG2P13727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG2P13727 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG2P13727 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG2P13727 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG2P13727 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG2P13727 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG2P13727 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG2P13727 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG2P13727 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG2P13727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG2P13727 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG2P13727 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG2P13727 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG2P13727 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG2P13727 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG2P13727 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG2P13727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG2P13727 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG2P13727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms