Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT13P13646 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT13P13646 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT13P13646 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT13P13646 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT13P13646 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT13P13646 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT13P13646 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT13P13646 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT13P13646 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT13P13646 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT13P13646 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT13P13646 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT13P13646 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT13P13646 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT13P13646 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT13P13646 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT13P13646 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT13P13646 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT13P13646 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT13P13646 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT13P13646 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT13P13646 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT13P13646 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT13P13646 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT13P13646 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT13P13646 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT13P13646 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT13P13646 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT13P13646 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT13P13646 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT13P13646 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT13P13646 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT13P13646 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT13P13646 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT13P13646 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT13P13646 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT13P13646 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT13P13646 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT13P13646 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT13P13646 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT13P13646 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT13P13646 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT13P13646 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT13P13646 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT13P13646 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT13P13646 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT13P13646 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT13P13646 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT13P13646 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT13P13646 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT13P13646 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT13P13646 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT13P13646 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT13P13646 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT13P13646 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT13P13646 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT13P13646 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT13P13646 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT13P13646 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT13P13646 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT13P13646 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms