Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CFTRP13569 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CFTRP13569 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CFTRP13569 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CFTRP13569 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CFTRP13569 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CFTRP13569 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CFTRP13569 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CFTRP13569 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CFTRP13569 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CFTRP13569 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CFTRP13569 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CFTRP13569 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CFTRP13569 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CFTRP13569 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CFTRP13569 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CFTRP13569 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CFTRP13569 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CFTRP13569 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CFTRP13569 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CFTRP13569 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CFTRP13569 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CFTRP13569 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CFTRP13569 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
CFTRP13569 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CFTRP13569 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CFTRP13569 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CFTRP13569 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CFTRP13569 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CFTRP13569 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CFTRP13569 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CFTRP13569 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
CFTRP13569 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CFTRP13569 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CFTRP13569 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CFTRP13569 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CFTRP13569 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CFTRP13569 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CFTRP13569 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
CFTRP13569 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CFTRP13569 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CFTRP13569 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
CFTRP13569 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CFTRP13569 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CFTRP13569 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CFTRP13569 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CFTRP13569 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CFTRP13569 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CFTRP13569 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CFTRP13569 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CFTRP13569 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CFTRP13569 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CFTRP13569 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CFTRP13569 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CFTRP13569 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CFTRP13569 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CFTRP13569 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CFTRP13569 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CFTRP13569 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CFTRP13569 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CFTRP13569 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CFTRP13569 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
CFTRP13569 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CFTRP13569 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CFTRP13569 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CFTRP13569 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CFTRP13569 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CFTRP13569 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CFTRP13569 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CFTRP13569 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CFTRP13569 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CFTRP13569 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CFTRP13569 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CFTRP13569 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CFTRP13569 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
CFTRP13569 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CFTRP13569 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43■■■■■ 4.47
CFTRP13569 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
CFTRP13569 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CFTRP13569 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CFTRP13569 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CFTRP13569 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CFTRP13569 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CFTRP13569 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.47
CFTRP13569 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
CFTRP13569 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CFTRP13569 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CFTRP13569 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CFTRP13569 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CFTRP13569 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CFTRP13569 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
CFTRP13569 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CFTRP13569 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CFTRP13569 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CFTRP13569 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CFTRP13569 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
CFTRP13569 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CFTRP13569 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CFTRP13569 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CFTRP13569 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms