Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL2P13500 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL2P13500 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL2P13500 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL2P13500 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL2P13500 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL2P13500 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL2P13500 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL2P13500 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL2P13500 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL2P13500 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL2P13500 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL2P13500 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL2P13500 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL2P13500 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL2P13500 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL2P13500 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL2P13500 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL2P13500 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL2P13500 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL2P13500 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL2P13500 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL2P13500 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL2P13500 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL2P13500 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL2P13500 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL2P13500 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL2P13500 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL2P13500 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL2P13500 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL2P13500 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL2P13500 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL2P13500 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL2P13500 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL2P13500 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL2P13500 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL2P13500 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL2P13500 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL2P13500 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL2P13500 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL2P13500 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL2P13500 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL2P13500 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL2P13500 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL2P13500 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL2P13500 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL2P13500 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCL2P13500 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL2P13500 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL2P13500 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCL2P13500 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL2P13500 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL2P13500 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL2P13500 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms