Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL6A2P12110 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL6A2P12110 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms