Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC43.94■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
TOP2AP11388 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOP2AP11388 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
TOP2AP11388 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC43.74■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2AP11388 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms