Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRAPPC2BP0DI82 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC2BP0DI82 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms