Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC166P0CW27 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms