Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC4P09017 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC4P09017 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC4P09017 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms