Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A2P08572 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A2P08572 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A2P08572 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms