Protein–RNA interactions for Protein: P08514

ITGA2B, Integrin alpha-IIb, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2BP08514 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA2BP08514 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA2BP08514 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA2BP08514 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2BP08514 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms