Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB1P08183 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms