Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT1P04264 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT1P04264 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT1P04264 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT1P04264 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT1P04264 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT1P04264 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT1P04264 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT1P04264 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT1P04264 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT1P04264 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT1P04264 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT1P04264 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT1P04264 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT1P04264 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT1P04264 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT1P04264 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT1P04264 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT1P04264 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT1P04264 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT1P04264 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT1P04264 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT1P04264 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT1P04264 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT1P04264 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT1P04264 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT1P04264 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT1P04264 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT1P04264 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT1P04264 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT1P04264 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT1P04264 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT1P04264 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT1P04264 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT1P04264 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT1P04264 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT1P04264 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT1P04264 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT1P04264 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT1P04264 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT1P04264 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT1P04264 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT1P04264 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT1P04264 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT1P04264 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT1P04264 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT1P04264 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT1P04264 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT1P04264 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT1P04264 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT1P04264 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT1P04264 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT1P04264 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms