Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNC2P02585 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC2P02585 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms