Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP1P01033 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMP1P01033 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TIMP1P01033 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms