Protein–RNA interactions for Protein: P00846

MT-ATP6, ATP synthase subunit a, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP6P00846 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ATP6P00846 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ATP6P00846 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ATP6P00846 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms