Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTL6AO96019 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms