Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX7O95931 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX7O95931 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX7O95931 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX7O95931 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX7O95931 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX7O95931 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX7O95931 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX7O95931 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX7O95931 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX7O95931 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX7O95931 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX7O95931 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX7O95931 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX7O95931 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX7O95931 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX7O95931 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX7O95931 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX7O95931 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX7O95931 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX7O95931 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX7O95931 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX7O95931 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX7O95931 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX7O95931 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX7O95931 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX7O95931 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX7O95931 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX7O95931 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX7O95931 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX7O95931 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX7O95931 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX7O95931 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX7O95931 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX7O95931 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX7O95931 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX7O95931 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX7O95931 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX7O95931 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX7O95931 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX7O95931 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX7O95931 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX7O95931 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX7O95931 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX7O95931 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX7O95931 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX7O95931 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX7O95931 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX7O95931 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX7O95931 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX7O95931 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX7O95931 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX7O95931 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX7O95931 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX7O95931 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX7O95931 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX7O95931 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX7O95931 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX7O95931 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX7O95931 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX7O95931 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX7O95931 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms