Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN4O95460 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN4O95460 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN4O95460 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN4O95460 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN4O95460 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN4O95460 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN4O95460 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN4O95460 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN4O95460 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN4O95460 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN4O95460 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN4O95460 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MATN4O95460 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN4O95460 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN4O95460 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN4O95460 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN4O95460 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN4O95460 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN4O95460 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN4O95460 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN4O95460 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN4O95460 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN4O95460 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN4O95460 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN4O95460 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN4O95460 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN4O95460 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN4O95460 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN4O95460 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN4O95460 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN4O95460 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN4O95460 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN4O95460 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN4O95460 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN4O95460 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN4O95460 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN4O95460 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN4O95460 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN4O95460 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MATN4O95460 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MATN4O95460 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN4O95460 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN4O95460 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN4O95460 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN4O95460 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN4O95460 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN4O95460 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN4O95460 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN4O95460 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN4O95460 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN4O95460 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN4O95460 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN4O95460 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN4O95460 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN4O95460 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN4O95460 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN4O95460 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN4O95460 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN4O95460 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN4O95460 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN4O95460 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN4O95460 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN4O95460 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN4O95460 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN4O95460 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN4O95460 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN4O95460 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MATN4O95460 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN4O95460 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN4O95460 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN4O95460 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN4O95460 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN4O95460 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MATN4O95460 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN4O95460 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms