Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIC2O95409 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIC2O95409 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms