Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX4O95219 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX4O95219 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX4O95219 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX4O95219 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX4O95219 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX4O95219 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX4O95219 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX4O95219 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX4O95219 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX4O95219 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX4O95219 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX4O95219 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX4O95219 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX4O95219 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX4O95219 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX4O95219 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX4O95219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX4O95219 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX4O95219 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX4O95219 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX4O95219 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX4O95219 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX4O95219 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX4O95219 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX4O95219 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX4O95219 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX4O95219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX4O95219 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX4O95219 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX4O95219 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX4O95219 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX4O95219 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX4O95219 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX4O95219 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX4O95219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX4O95219 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX4O95219 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX4O95219 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX4O95219 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX4O95219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX4O95219 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX4O95219 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX4O95219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX4O95219 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX4O95219 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX4O95219 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX4O95219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX4O95219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX4O95219 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX4O95219 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX4O95219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX4O95219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX4O95219 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX4O95219 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX4O95219 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX4O95219 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms